北京基因組所生命與健康大數(shù)據(jù)研究獲進展

來源：北京基因組研究所 時間：2018-01-11 11:49:38 作者：

　　1月4日，《國際核酸研究》（Nucleic Acids Research）數(shù)據(jù)庫?？?，連登四篇中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數(shù)據(jù)研究成果，包括生命組學數(shù)據(jù)資源建設成果（D14-20）、實時定量PCR內參基因知識庫——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化數(shù)據(jù)庫Methbank升級版（D288-295）以及基因組序列變異庫——GVM（Genome Variation Map；D944-949）。四篇文章的發(fā)表，標志著我國綜合型生物信息資源庫建設獲得國際同行進一步認可。

　　自上世紀60年代以來，國際生物信息學家建立了一系列的數(shù)據(jù)庫。特別是上世紀90年代，隨著人類基因組計劃的展開以及網(wǎng)絡在全球普及，數(shù)據(jù)庫數(shù)量和體量迅猛增加，形成了以NCBI、EBI、DDBJ等為代表的多個國際大數(shù)據(jù)中心。隨著測序技術不斷發(fā)展，我國已成為國際基因組數(shù)據(jù)最大產(chǎn)出國之一，但我國產(chǎn)出的組學數(shù)據(jù)絕大部分必須提交到國外數(shù)據(jù)庫才能得到認可。據(jù)Database Commons數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計，我國數(shù)據(jù)庫資源總數(shù)已位居世界第二，但大部分數(shù)據(jù)庫沒有進行長期運行維護，嚴重缺乏深度人工審編，數(shù)據(jù)庫內容邊緣化，最終結果是大量數(shù)據(jù)庫資源質量不高，利用率低。

　　北京基因組所面向國家大數(shù)據(jù)發(fā)展戰(zhàn)略和科技創(chuàng)新戰(zhàn)略，成立生命與健康大數(shù)據(jù)中心，建立生物大數(shù)據(jù)儲存、整合與挖掘分析研究體系，構建的GSA（Genome Sequence Archive）數(shù)據(jù)庫已開展原始組學數(shù)據(jù)存儲與共享服務，并與國際接軌，存儲的數(shù)據(jù)已支持Cell、Nature Communications、PNAS、Genome Research等雜志文章發(fā)表，建成我國生物大數(shù)據(jù)匯交共享平臺，成為繼NCBI、EBI、DDBJ之后第四個綜合基因組權威數(shù)據(jù)庫。同時，建成生物大數(shù)據(jù)多層次組學層面的數(shù)據(jù)資源體系，包括基因組歸檔數(shù)據(jù)庫Genome Warehouse、基因組變異數(shù)據(jù)庫Genome Variation Map、基因表達數(shù)據(jù)庫Gene Expression Nebulas、甲基化數(shù)據(jù)庫Methylation Bank、生物知識庫Science Wikis，對我國科學研究和產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展起到了重要支撐作用。

?

責任編輯：陳近梅